One thousand compounds!
Será que podemos desafiar o livro-texto?
É relativamente comum entre muitos alunos questionar alguma divergência entre o livro-texto e o enunciado do Professor. A premissa parece estar relacionada ao fato de que o livro-texto “está escrito“. O Professor, por outro lado, anuncia o conceito verbalmente. O desafio está na arena! Os motivos ficam para outra postagem. Mas, a relação ensino-aprendizado fica abalada. Assim, comumente, e o que é pior, estabelecer-se-á uma certa relação de desconfiança. Vamos ao invés de qualificá-lo como problema, rotulá-lo como desafio. E aqui vai um: “Quantum mechanical mechanism behind 100-year-old textbook reaction revealed“. Se você tiver acesso ao texto primário, acesse aqui.
QM/MM em ação
O Professor Jerônimo Lameira Silva está disposto a co-orientar discentes em parceria com Professor Carlos Alberto Montanari no Instituto de Química de São Carlos. O Prof. Jerônimo Lameira desenvolve pesquisa nos seguintes temas: Simulação computacional de catálise e inibição enzimática, modelagem de proteínas, métodos hibridos QM/MM e dinâmica molecular. O professor Lameira ficará como Pesquisador visitante de Janeiro de 2019 a Janeiro de 2020 no Laboratório do Professor Montanari, onde irá desenvolver o estudo computacional de inibidores da enzima cruzaína. Mais informações sobre o trabalho do professor Lameira pode ser encontrado no endereço: http://lattes.cnpq.br/7711489635465954

O NEQUIMED/IQSC/USP, em parceria com grupos especializados em parasitologia do Trypanosoma cruzi, o agente causador da doença de Chagas, identifica novos candidatos a fármacos para o tratamento dessa doença. Uma das etapas fundamentais da gênese planejada de fármacos, nessa fase do processo, é o escalonamento da síntese para a produção dos produtos desejados em escala de gramas. Os ensaios in vivo são agora essenciais para a avaliação da potência e toxicologia, com consequente determinação da dosagem. Os químicos sintéticos desejosos em contribuir para a química medicinal sintética com escalonamento e melhora dos rendimentos das reações são bem-vindos a juntar-se ao nosso grupo. Os interessados devem enviar mensagem através de nossos contatos.
Descoberta sim. Recompensa talvez!
“O treinamento recebido no grupo não é previsível nem quantificável; da mesma forma, não se pretende produzir um produto que, por exemplo, a indústria deseja. Desde que nada original é intencionalmente descoberto por cientistas que não toleram um alto grau de incerteza (na verdade, deveriam aceitá-la), o grupo per se não garante resultados. Por causa da natureza de nossa pesquisa, no entanto, os membros do grupo se pré-selecionam e possuem um alto grau de independência de pensamento, bem como motivos científicos voltados para a descoberta, não para a recompensa. Barry Sharpless.
“The training received in the group is neither predictable nor quantifiable; likewise, it is not intended to produce a product that, for example, industry wants. Since nothing original is intentionally discovered by scientists who cannot tolerate (indeed, they should welcome it) a high degree of uncertainty, group membership does not guarantee results. Because of the nature of our research, however, group members preselect themselves and possess a remarkably high degree of independence of thought as well as scientific motives tilted toward discovery, not reward.” Barry Sharpless.
NEQUIMED/IQSC/USP na mídia
Três novas substâncias desenvolvidas no Instituto de Química de São Carlos (IQSC) da USP apresentaram ótimos resultados na missão de combate à doença de Chagas.
Publicado por Rádio UFSCar 95,3 FM em Sexta, 14 de setembro de 2018
CalCon2018. Prof. Michael Gilson Talk
Prezados(as),
O Prof. Michael Gilson, UCSD, gentilmente ofereceu sua apresentação e gravação sobre sua apresentação recente durante a CalCon2018.
“In case you or your students are interested in my lecture from CalCon, I recorded the audio and posted it here while the slides are here.”
Obrigado Mike.
Carlos Montanari
Sobre o NEQUIMED/IQSC/USP
Veja aqui porque você deveria trabalhar no NEQUIMED/IQSC/USP.
Planejamento Molecular e o Engajamento do Alvo
O engajamento do alvo em programas de descoberta de fármacos (veja aqui) encompassa a correta descrição e identificação do alvo biomacromolecular tanto em experimentos in vitro (ensaios baseados em células) como in vivo. Seu correto entendimento melhora a capacidade da química medicinal em planejar novos agentes químicos com ação biológica sobre o alvo desejado. Não falo essencialmente sobre o alvo biomacromolecular isolado. Ou seja, a definição do estado de doença com base em um alvo que é produzido de forma recombinante usando um hospedeiro. Esse, muitas vezes, é passível de modulação in vitro em ensaios bioquímicos ou biofísicos. A correta transferência da inibição do alvo in vitro para a ação do agente químico em experimentos baseados em célula (in vitro) ou em animais (in vivo) é essencial para a sua validação como alvo. Além disso, é fundamentalmente necessário que seja descrita a relação estrutura-atividade (SAR) pertinente, sob a pena de fracassar em experimentos ulteriores. Facilitar o engajamento do alvo biomacromolecular, resulta em seletividade com melhor avaliação da fase farmacodinâmica do processo. Evita efeitos off-target e ajuda na validação do alvo. A gênese planejada de fármacos é longa e complexa. Os ensaios in vivo em modelos animais adequados é importante para a transição das fases pré-clínicas para as fases clínicas. A correta indentificação e seleção de animais-modelo é pivotal nesse processo. Naturalmente, o engajamento do alvo deve ser efetivamente avaliado nesse estágio considerando-se, principalmente, que muitos candidatos a fármacos que são descontinuados das fases clínicas o são também por falta de aderência ao alvo previamente imaginado como essencial para a atividade farmacológica de interesse. O pipeline de identificação de pequenas substâncias químicas bioativas deve ser adequado e eficientemente estabelecido em projetos de descoberta e desenvolvimento de novos candidatos a fármacos. Por exemplo, a AstraZeneca identificou recentemente cinco determinantes técnicos que são críticos para o sucesso do projeto (amoedado aqui como os ‘cinco C’s’): o alvo certo, o paciente certo, o tecido certo, a segurança certa e o potencial comercial correto.